RDKIT을 사용하여 3D conformer 생성 – Knime
https://youtu.be/KwtAxw2HU1g Knime에서 2차원 화학구조로 부터 가상탐색(virtual screening)에 활용할 수 있는 다양한 conformer구조들을 분자역학(molecular mechanics)적 방법으로 생성하여 저장하는 방법을 실습합니다.
Conformational search – MarvinSketch, MarvinView
https://youtu.be/cEXm27x4ly8?si=DOI6Hc6XopueOROT ChemAxon사의 MarvinSketch와 marvinview를 이용하여 2차원 분자구조의 3차원 conformational search를 수행하여 보여줍니다.
Conformational search and MOPAC calculation – Molecular Operating Environments (MOE)
https://youtu.be/W9Wjj89cTcQ?si=1s-GEf6YeIEv0oZc MOE 프로그램을 이용하여 작은 분자의 conformational search를 통해서 존재할 수 있는 다양한 conformer들을 생성하는 과정과 semi-empirical method로 계산되는 MOPAC계산 결과를 통한 시연으로 보여주고 있습니다.