RDKIT으로 reactive group을 지닌 분자 거르기 – Knime
https://youtu.be/PQhLhOsQ6GQ HTS에서 자주 hit가 되는 반응성 있는 화합물군들을 Knime에서 하부구조검색을 통해 한꺼번에 제거하는 과정을 실습합니다.
RDKIT으로 diverse library 선택하기 – Knime
https://youtu.be/ngQZu3cNiOg Knime에서 분자지문(molecular fingerprint)를 이용하여 많은 library분자들로부터 대표하는 다양한 library로 선택하는 과정을 실습합니다.
RDKIT을 사용하여 3D conformer 생성 – Knime
https://youtu.be/KwtAxw2HU1g Knime에서 2차원 화학구조로 부터 가상탐색(virtual screening)에 활용할 수 있는 다양한 conformer구조들을 분자역학(molecular mechanics)적 방법으로 생성하여 저장하는 방법을 실습합니다.
Knime에서 RDKIT을 사용하여 inchi, smiles 생성
Knime에서 화학구조 및 처리 계산등에 사용하는 community node인 RDKIT을 설치하고, 이를 통해 구조 및 inchi, smiles코드를 생성과정을 실습합니다.